高次系統の解析に必要な5遺伝子領域（ボニ―やりすぎだよ）のシーケンスが一通り終わった。計1300bpほどと少ない・・・。クレードの支持が得られたらいいのだが、さすがにもう少し増やそうと思う。温度を変えてPCRを再開する。 査読も進める。

シーケンス結果はよくもないがわるくもない。面倒だが内部プライマーの2nd PCRとかやっていくか・・・。今週の実験は疲れたが、サンプルの傾向がわかったのが収穫だ。 平尾台の論文がJ. Ins. Con.に早速引用されていて嬉しい。「生物多様性の保全」「持続可…

シーケンスの一部。この種はあの簡単なWinglessでさえ片方のみか。Long wavelength rhodopsinはまあこんなものでしょう。部分的ではあるがよかった。ほっとする。Arginine kinaseにはほとんど期待していないが、Topoisomerase 1とCADはいくらか欲しい。

一連のPCRはひとまず終わった。うまくいったのは5割くらいだろうけど、こんなものである。論文中に3000bpとかあっても、種によっては1000〜2000bpぐらいしかないとかいうのはよくある。つぎはぎでもいいので増やしていきたい。明日からシーケンス。 緊迫した…

英文校正の見積もりが6万円ほどであった。もう何も気にせず依頼のメールを送る。私の経費で払うわけではないので、気にするもしないもないのだ（でも高いよなあ・・・）。 ピペットマンの修理見積もりが来る。すぐに修理お願いしますのメール。こっちも気に…

実験結果にへこんで、次に期待する。 来月はクリスマスシーズンとかで欧米ではお休みムードでしょうから、この11月中になんとか1本投稿してreviewの返事がなるべく早く返ってくるようにもっていきたい（でも今投稿してもあんまり変わらんか）。あくまで個人…

Wendyから共同研究の話があって、関連論文を送ってくれたのはCladisticsのやつ。理解するのが面倒そうだが面白そう。やっぱりngsとかメタ解析とか避けられないのか。 忘年会の場所・日時を決める。例年12月は教員の出張が多く、ピンポイントで日程が決まって…

実験の続き。今日のはいまいち。よくあること。 論文の下地書き。分野が違うと執筆が捗る捗る。

ハイシーズンなようだからマムンのホテル予約もしておく。彼は今日からバングラへ一時帰国。 核遺伝子領域も順調に増えた。サンプル状態がそれほどよくなかったので、これはいい兆候。計5遺伝子で、PCRは20回程度必要になるのが面倒だ。1500〜2000bpくらいシ…

マムンのシーケンス結果は不完全であるが、一部は得られたので使えそう。なんで毎回ミスが多いのか。来週は私がやってみて確かめる。 査読の続き。そんなに修正するところがなく、こちらも参考になる表現があったりして助かる。数か所気になる点を挙げておく…

CJNHの最新号が出る。稀な属を紹介したというだけですが、カンボジアでのアリ研究につながればという思いです。この最新号をよく見たら植物も2報出ているではないか。「グローバルCOEコアサイト」、「アジア保全生態学」である。 Cambodian Journal of Natur…

マムンのシーケンスを予約する。バングラに行く前にやっておきたいという。別にやらんでいいのに、変な所で頑張るみたい。 グルタルアルデヒドの濃度を調整して予備的に使う。これで材料だけは問題ないであろう。 DNA抽出用のサンプルを準備。系統的位置を探…

応動昆との合同大会が来年3月にあるが、その要旨締め切りが12月24日と約1カ月しかない。本当にどうしようか。マムンのもどうするか考えないといけない。 堺周辺のホテルをひとまず予約したが、とても少なくなっている。しかも高い。

ベトナムからのお客様と新入生の歓迎会ということで、なぜか外でBBQ。寒くないかなと思いましたが、比較的暖かい日でよかった。しかし、早く暗くなるので肉が焼けているのか見えない・・・。みんなスマホの照明で確認することに。

固定液と緩衝液を作って、アリを入れる。たぶんあまり上手くいかないかもしれないが、まずは第一歩。

やっとグルタルアルデヒドやカコジル酸ナトリウムを使うときが来た。新しいことを始める不安があるが楽しみでもある。

スリランカとシンガポールから帰国しました。目的の種を採ることができて満足。いろいろな実験に使っていきたい。